Школа родилась 19 октября 1963 года.
Первый директор - Яковлева Галина Михайловна
1965 - 1988 г. г. директор - Сиволобов Петр Спиридонович. Заслуженный учитель РСФСР.
1988-1998 г.г. директор - Лукичева Валентина Александровна, Отличник Народного просвещения, Заслуженный учитель РФ.
В 1998 году гимназию возглавила Борисова Татьяна Константиновна - Отличник народного просвещения РФ.
У истоков школы стояли: Медведева А.Н., Копылова Р.В., Виноградова И.В., Спицина Г.С., Орехова В.Г., Семашко Н.Н., Кокорина Л.А., Сиволобова Г.Д., Хмельницкий М.С. - учителя, которые внесли большой вклад в развитие ее системы образования, некоторые из них работают и сейчас.
С первых дней школа являлась экспериментальной площадкой Министерства просвещения в городе Новосибирске. Именно в нашей школе впервые стали создаваться классы с углубленным изучением различных предметов, кабинетная система обучения.
С 1983 года на базе школы была создана лаборатория Министерства просвещения РСФСР под руководством академика Ершова А.П., школа стала базовой школой города во всесоюзном эксперименте по внедрению информатики в учебный процесс
В 1983 году наши ученики были участниками различных олимпиад, конференций и слетов во многих городах России (Москве Челябинске, Ленинграде, Минске, Нальчике) и за рубежом (Чехословакия).
В 1985 году начинает работать конструкторское бюро под руководством изобретателя Федосеева Г.С. Учащиеся получили 27 авторских свидетельств на изобретения.
В 1989 году школа награждена Большой Серебряной медалью ВДНХ за разработку сценариев программных средств, реализацию и внедрение их в учебный процесс.
В 1995 году школа получила Гранд Сороса <За успехи в области изучения гуманитарных наук>.
В 1996 г. присвоен статус городской гимназии № 5. В этом же году школа стала лауреатом Всероссийского конкурса <Школа года 1996>.
В 1996, 1997 годах учащиеся гимназии становились победителями Открытого конкурса программы <Молодые информатики Сибири>.
В 1997 г. - присвоено звание <Школа года 1997>.
С 1997 г. гимназия является участницей <Сибирской Ярмарки>, где представляет свои методические разработки. В 2000 году гимназия получила Большую Золотую медаль Сибирской Ярмарки в VIII образовательной выставке <Учсиб -2000> в номинации <Образовательные модели в художественно-творческой деятельности>.
В 1998-99 году гимназия завоевала 1 место в Советском районе по результатам участия в районных и городских олимпиадах и научно-практических конференциях.
С 1998 года в гимназии реализуется международная программа (Проект-НОРЕ) <Полезные привычки> (Профилактика вредных привычек табакокурения и алкоголизма) 1-5 классы, <Полезные навыки> (Профилактика наркомании) 6-8 классы, <Мой выбор> 9-11 классы.
Центр культуры здоровья с 1998 года является экспериментальной площадкой Городского центра образования и здоровья <Магистр>. В центре работают: руководитель центра, 2 социальных педагога, 2 психолога.
С 2000 года гимназисты имеют возможность пройти компьютерный игровой БОС-тренинг <Профилактика стресса и его последствий у подростков>, разработанный в институте медицинской и биологической кибернетики СО РАМН.
Гимназия является участницей международных программ, таких как <Культура и здоровье>, <Образ и мысль>, всероссийских программ - <5 по зрению>, <Рациональное питание>.
С 2002-2003 гимназия является участником Российско-американской программы по обмену школьниками. Итогом программы стал обмен делегациями.
В 2000 году гимназия получила Большую Золотую медаль Сибирской Ярмарки в VIII образовательной выставке <Учсиб -2000> в номинации <Образовательные модели в художественно-творческой деятельности;
диплом <Учсиб -2001> за <Образовательные технологии в сфере специального образования>;
диплом <Учсиб -2002> за <Концепцию программы по созданию здоровьесберегающего пространства в образовательном процессе гимназии, новый взгляд на традиции отечественного образования>.
В 2000 году авторский коллектив гимназии награжден дипломом 1 городского конкурса здоровьесберегающих программ, технологий, методик за разработку и внедрение проекта <Здоровье в системе учитель-ученик> и методических рекомендаций <Здоровье- зрение>.
В 1999-2000, 2000-01 годах учителя гимназии становились победителями Российско-американского конкурса преподавателей английского языка (АСПРЯЛ).
В течение пяти лет школа являлась призером районной военно-спортивной игры <Зарница>, представляла район на городских и региональных соревнованиях .
В 2006 году гимназия заняла 2 место в районе в смотре <Вахта памяти> у Поста №1.
В 2000 г. команда учащихся гимназии заняла 2 место в городском валеологическом конкурсе <Неболит-2000>, 2006 году - 4 место, 2007 году - 4 место.
В 2001- 2006 годах гимназия награждалась грамотами <За высокие результаты учащихся в международной игре <Кенгуру>.
В 2001 г. стала призером городского тура <Интеллектуальных игр>
Учащиеся гимназии ежегодно становятся призерами и победителями олимпиад и научно-практических конференция различного уровня.
В 2003 году японский театр <Яшмовое ожерелье> выступал в Хоккайдо-центре г. Новосибирска и был награжден грамотой посольства Японии в России за 2 место в конкурсе <Хайку>.
В 2004 году театральная студия гимназии заняла 1 место в районном конкурсе <Времен связующая нить>:, стала лауреатом городского конкурса <Театральная весна>.
Учащиеся гимназии ежегодно становятся победителями и призерами районных, городских конкурсов вокального творчества <Пою мое Отечество>, <Весенние голоса>, <Солнечный микрофон>, <Жемчужина Сибири>.
В 2004 году танцевальный коллектив гимназии занял второе место в городском конкурсе <Танец-плюс>.
С 2006 г. гимназия является базовым учреждением по разработке и апробации здоровьесберегающих технологий в системе образования.
В 2006 г. коллектив гимназии выиграл грант образовательной программы SEED фирмы Шлюмберже на поставку компьютерного класса и бесплатного Интернета в течение двух лет